生物信息学
未读一、Linux操作系统二、生物信息学种的编程语言三、SQL及数据库编程四、并行计算
生物信息学
未读基础篇
Entrez 使用几种逻辑运算符对检索关键词做最基本的限制?
A. 1种B. 2种C. 3种D. 4种答案：__C__解析：点击查看答案
Entrez 中有一些内置的特征可以帮助建立更具效率的搜索，包括布尔操作符、查询语句及数据库包括的所有可用的标签。布尔操作符（逻辑运算符）包含AND、OR、NOT 3种操作符；使用时AND要求为大写，最好3种操作符均为大写考点出处： 第二章——生物学数据库及其检索
提交序列到 GenBank 中，使用的程序可以是：A.EntrezB.SRSC.MedlineD.BankIt答案：__D__解析：点击查看答案
无考点出处：
题目三A.B.C.D.答案：__C__解析：点击查看答案
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题目四A.B.C.D.答案：__C__解析：点击查看答案
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生物信息学
未读第一节、合成生物学1、合成生物学的定义2、合成生物学的工程本质
生物信息学
未读一、蛋白质组学概述“蛋白质组学“（Proteomics）和“蛋白质组”（Proteome）是澳大利亚科学家 Marc Wilkins 及其同事在 20 世纪 90 年代初提出的，与 “基因组学”（Genomics）和“基因组”（Genome） 相对应，意为“一个基因组、一种生物或一种细胞、组织所表达的全套蛋白质
组学：对生物学和生物体系运作的已汇总全局的研究方式，即从整体的角度来研究一个生物体、细胞或组织。
1.1 基因组学的产生及研究进展基因组学（Genomics）: 研究生物基因组和如何利用基因的一门科学。
基因组学分类
结构基因组学：全基因组测序
功能基因组学：基因功能鉴定
基因组学的局限：
基因组学推测的大量蛋白功能未知。
蛋白功能只能依靠同源基因分析类推和预测
一个基因并不代表唯一一种蛋白。
一个蛋白在转录、翻译、折叠、修饰中可能有无限变化。
蛋白质无法PCR扩增，无法大规模自动化测序。
1.2 蛋白质组学的产生及研究进展1.蛋白质组学的产生 蛋白质本身的存在形式和活动规律，如翻译后修饰、蛋白质间相 互作用及蛋白质构象等问题，仍依赖对蛋白质的研究来解决。 ...
生物信息学
未读第一节 非编码RNA的概述
除mRNA以外，生物体内还存在许多不编码蛋白质的RNA，直接在RNA水平上发挥作用，称为非编码RNA（non-coding RNA,ncRNA）
人类基因组中大于50%的DNA可以转录为RNA，其中只有2%能够翻译成蛋白质（mRNA），其余98%不能翻译成蛋白质，这些不能翻译成蛋白质的RNA被称为非编码RNA。
人类基因组的30亿个碱基对，其中1.5%为蛋白质编码序列；75%可以转录为RNA；非编码RNA占总RNA的74%；作用：调控；
2006年诺贝尔生理学或医学奖：RNA干扰（RNA interference，RNAi）现象。
一、非编码RNA的特征根据碱基长度，以200nt为界限，分为 短链RNA（small ncRNA，sncRNA）和长链RNA【含：长非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）等，环状 RNA（circular RNA， circRNA）】
具体分类如下：
生物信息学
未读一、转录组学概述转录组学是从RNA水平研究基因表达情况，系统性地揭示细胞中基因转录调控规律，对于探究生命活动的相关机制具有重要意义。
1.1转录组学的产生
2023年8月14日雷军以“成长”为主题举行了第四次年度演讲，并举行了小米新品发布会，作为一个米粉自然不能缺席。此文记录了一些对于IT以及对于大学生活的一些小小的感悟。
演讲内容总结：
遇到问题的时候不要一个人琢磨，学会问人，实际上99%的问题都有标准答案。
知识不全是线性的，大部分是网状的，知识点之间不一定有绝对的先后关系;前面内容看不懂，跳过去，并不影响学后面的，后面学会了，有时候更容易看懂前面的。
哪些可能看起来很远很了不起的目标，也许并没有那么难，你去试一下，说不定就成了。
幸运的是，我学会了把梦想当回事儿，并且相信梦想的力量。
人因梦想而伟大，又因坚持梦想而成长。
只有认知的突破，才会有真正的成长。
一个人可能走的更快，但一群人，才能走的更远。
每一段经历，每一次蜕变，都是一次认知的突破，更是一次关键的成长。
只有脚踏实地的成长，才有足够的自信、勇气与决心去迎接所有未知的挑战;只有脚踏实地的成长，才能让自己内心充实，眼里有光，时时刻刻充满力量。
人生是一场马拉松，一时的成败没那么重要，所有的人生难题，都将在成长中找到答案。
探索，就是要进入到一个未知的无人区，去走没有人走 ...
之前在实验室学习的时候看到超哥一直在使用Vim编辑器，后来在Linux环境下进行一些文件配置的时候，也常常使用，很早就想对于Vim进行一次系统的了解和相关操作归纳，只不过一直没有开始。直到昨天，在论坛和朋友圈看到Vim编辑器创始人去世的消息。
一、Vim是什么Vim是一个高度可配置的文本编辑器，用于创建和更改任何类型的文本非常高效。与大多数UNIX系统和Apple OS X一起，它被包含为“vi”。Vim是稳定的，并且不断发展，变得更好。其特点是：持久的多级撤消树；广泛的插件系统；支持数百种编程语言和文件格式；强大的搜索和替换；与许多工具集成。
Vim是Vi IMproved，是编辑器Vi的一个加强版，一个极其强大并符合IT工程师（程序员、运维）习惯的编辑器。如果你是一名职业的SE，那么一定在寻找一款出色的能够自由定制、满足灵活编辑功能的编辑器。那么答案，就是vim或者Emacs。vim最大特色是完全使用键盘命令进行编辑，脱离了鼠标操作虽然使得入门变得困难，但上手之后键盘的各种巧妙组合操作却能带来极为大幅的效率提升。
在Linux系统中，RHEL和CentOS的配置文件是/ ...
数据结构学习记录，部分图片来自于代码随想录，侵权删~
一、数组的基本概念
数组是存放在连续内存空间上的相同类型数据的集合。
可以通过下标索引的方式获取到下标下对应的数据。
数组下标都是从0开始的。
数组内存空间的地址都是连续的，因此删除某个元素之后就需要将该元素后的所有元素都要做移动操作。
数组的元素是不能删的，只能覆盖。
二维数据的地址不一定是连续的，不同语言的设计原理不同。
二、二分查找
Leetcode题目链接 704.二分查找
思路
前提：
有序数组
数组中无重复元素
主要问题是区间的定义问题：
代码Go版本123456789101112131415func search(nums []int, target int) int { left,right := 0, len(nums)-1 for left <= right{ mid := (right - left)/2 + left num := nums[mid] if num == target { ...
生物信息学
未读
基础知识补充：
真核细胞：eukaryotic cell 指含有真核（被核膜包围的核）的细胞。其染色体数在一个以上，能进行有丝分裂。还能进行原生质流动和变形运动。处蓝藻和细菌外，所有的动物细胞和植物细胞都是真核细胞。
真核生物：由真核细胞构成的生物
基因组：指生物体所有遗传物质的总和。这些遗传物质包括DNA或RNA（病毒RNA）。
基因组注释内容
各类功能元件
编码蛋白质的基因
RNA基因
重复序列
假基因等
各元件对应的生物学功能
确定蛋白质编码基因及其外显子-内含子结构（基因结构），并推断其生物学功能
进行RNA基因的预测，并推断其功能和相互作用标靶分子
确定基因组中重复序列的含量和分类
进行假基因的识别和分类
一、蛋白质编码基因的注释1.1 蛋白质编码基因的注释策略主要分为3种策略，各有有点，目前成功的做法是将3种策略的预测结果进行整合，得到比较理想的结果
基于证据的基因注释
定义：根据已有实验证据（如cDNA）表达序列标签（EST）和蛋白质序列进行蛋白质编码基因的注释
分类（根据cDNA或者蛋白质序列是否由一个基因自身转录或翻译而来）
顺式对比
常用 ...
